用于靶向 DNA 和 RNA 測序的 CleanPlex 擴增子測序技術

更新時間：2024-03-08 點擊次數：1054

CleanPlex ®是一種超可擴展且超靈敏的NGS 擴增子測序技術。它具有高度先進的專有多重 PCR 引物設計算法、極其均勻的多重 PCR 擴增化學物質和創新的背景清潔化學物質。它們共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能夠突破傳統的基于擴增子和基于混合捕獲的目標富集技術的限制。

功能亮點：

超高的擴增均勻性和超低的PCR背景噪音（更準確的變異調用或更低的測序成本）
單管 3 小時工作流程，手動操作時間最少（輕松自動化）
兼容困難樣品（降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA）和主要測序平臺（Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq）
高的靈敏度（低至單細胞水平直接擴增*）
出色的面板大小可擴展性，單個多重 PCR 池中的擴增子數可達 20,000 多個
檢測和分析單核苷酸變異（SNV）、小插入和缺失（Indels）、拷貝數變異（CNV）、基因融合/剪接變異、基因表達水平、腫瘤突變負荷（TMB）、微衛星不穩定性（MSI）、內部串聯復制（ITD）等

具體來說，擴增子測序技術提供了一種專注于特定基因或特定感興趣基因組區域的靶向方法。
全基因組測序（WGS）及其相應的全基因組擴增（WGA）方法更適合研究和發現類型的應用，而靶向測序或靶向基因測序對于許多快速增長的臨床和工業應用至關重要，這些應用的成本和速度都受到限制。更重要。

基因組學界面臨的挑戰之一是持續獲取大量測序原始數據，這些數據尚未全成功地翻譯和解釋，以幫助在更廣泛的范圍內推進研究、診斷和治療疾病。即使目前測序成本降低，全基因組測序方法實際上也只能用于基礎研究、群體遺傳學或罕見疾病檢測等特定場景。有針對性的或有針對性的方法將更適合了解疾病進展并指導臨床環境中的治療選擇或在工業應用中大規模篩查 DNA 樣本。此外，就實驗室操作和用于存儲和處理大量數據的生物信息學基礎設施而言，對整個基因組或外顯子組進行測序可能非常昂貴。因此，靶向測序對于精準醫療和研究的持續進步變得至關重要。

圖 2. CleanPlex DNA 靶標富集和文庫制備工作流程

圖 3. CleanPlex RNA 靶標富集和文庫制備工作流程

Paragon Genomics 總部位于舊金山灣區，是一家快速發展的精準醫療公司。我們的靶向測序技術CleanPlex® DNA、CleanPlex® RNA、CleanPlex® UMI和OmniFusion™為精準腫瘤學、傳染病檢測、遺傳性疾病檢測、單細胞分析、分子育種和許多其他應用提供全面的解決方案。